商品從物流中心送出之前可在物流中心做流通加工處理。在物流中心的各項作業中以流通加工最易提高貨品的附加值，其中流通加工作業包含商品的分類、過磅、拆箱重包裝、貼標簽及商品的組合包裝。而想要達成完善的流通加工，必須要做的便是執行包裝材料及容器的管理、組合包裝規則的制定、流通加工包裝工具的選用、流通加工作業的排程、作業人員的調派。

完成貨品的揀取及流通加工作業之后，即可執行商品的出貨作業，出貨作業主要內容包含依據客戶訂單資料印制出貨單據、訂定出貨排程、印制出貨批次報表、出貨商品上所需要的地址標簽及出貨檢核表。

由排程人員決定出貨方式、選用集貨工具、調派集貨作業人員，并決定所運送車輛的大小與數量，由倉庫管理人員或出貨管理人員決定出貨區域的規劃布置及出貨商品的擺放方式。

配送商品的實體作業包含將貨品裝車并實時配送，而達成這些作業則須事先規劃配送區域的劃分或配送路線的安排，由配送路徑選用的先后次序來決定商品裝車的順序，并于商品的配送途中做商品的追蹤及控制、配送途中意外狀況的處理。

商品出庫后銷售部門可依據出貨資料制作應收帳單，并將帳單轉入會計部門作為收款憑據。而于商品購入入庫后，則由收貨部門制作入庫商品統計表以作為供貨廠商請款稽核之用，并由會計部門制作各項財務報表以供營運政策制定及營運管理之參考。

除了上述物流中心的實體作業之外，良好的物流中心運作更要基于較上階層的管理者透過各種考核評估來達成物流中心的效率管理，并制訂良好的營運決策及方針。